內鏡超聲檢查是一種新的醫學影像學檢查技術，使用特殊儀器將內鏡插入受檢者的消化道或腔道，從而觀察食管、胃、十二指腸、結腸等器官的病變，可以輔助診斷消化道疾病，如食管炎、胃炎、腸炎等。

1、食管炎：通過內鏡可以看到食管黏膜有充血、水腫，或黏膜剝脫等異常情況，在內鏡下取活檢，送病理檢查后可以確診。患者出現反酸、燒心、胸骨后疼痛等癥狀時，可以通過內鏡檢查明確是否患有食管炎;

2、胃炎：通常有非甾體類抗炎藥服用史的患者，可能會出現胃炎，如果出現消化不良、腹痛、反酸等癥狀，可以通過內鏡檢查胃黏膜是否有損傷、充血、水腫等異常情況;

3、腸炎：通常是伴有腹痛、腹瀉、血便、發熱等癥狀的患者，可以通過內鏡檢查腸道是否存在病變，如果在內鏡下表現為腸道黏膜充血、水腫，可能是出現腸炎;

4、結腸炎：結腸炎患者在炎癥發作時，可能會出現腹瀉、黏液便、膿血便等癥狀，也可通過內鏡檢查明確結腸是否存在損傷。

除上述疾病外，胃息肉、結腸息肉、直腸息肉、膽管壁增厚、膽管擴張、胰腺疾病、肝硬化、脂肪肝等都可以通過內鏡超聲檢查輔助診斷。另外，部分進行內鏡治療的患者也可以通過內鏡檢查來評估治療效果。

部分患者可能因為體質較差不能耐受內鏡檢查，而不能進行內鏡檢查，如心臟病患者。通常情況下，內鏡檢查前要進行心電圖檢查，并且空腹8小時以上，避免由于進食導致檢查結果不準確。