超聲內鏡檢查是指在消化內鏡中心，通過內鏡來觀察消化道有無病變的一種檢查方式，主要用于檢查食管、胃、小腸、大腸等上消化道的疾病。不同的疾病檢查時長也不一樣，如胃部疾病、食管疾病、小腸疾病等，一般情況下，檢查時間大概為3-5分鐘。

1、胃部疾病：如胃潰瘍、胃炎等，由于胃部黏膜受到損傷，需要明確病變的具體情況，可能需要病變部位通過超聲內鏡進行檢查，一般操作時間在3-5分鐘即可;

2、食管疾病：如食管炎、反流性食管炎等，由于食管部位受到損傷，需要明確病變的具體情況，可能也需要經過超聲內鏡進行檢查，操作時間大概為3-5分鐘;

3、小腸及大腸疾病：如小腸潰瘍、結腸腫瘤等，在進行檢查時，也需要經過超聲內鏡，因為是在內鏡的觀察下進行相應的治療操作，所以操作時間可能較長，一般在10-20分鐘;

4、肝臟疾病：如肝膿腫、肝癌等，因為肝臟部位需要進行超聲內鏡檢查，所以需要的時間可能較長，因為肝臟部位的病變情況比較復雜，除了超聲內鏡檢查外，還需要其他檢查綜合分析才能明確診斷，所以時間會相應延長，具體時間因人而異。

此外，超聲內鏡檢查還有插管胃鏡檢查的使用，不同的疾病可能需要不同的插管方式及操作時間。超聲內鏡檢查時可能會對被檢查者造成一定不適感，所以在檢查時會有心理準備，不要過于緊張，配合醫生操作即可。