超聲可以檢查出肛瘺，而且超聲檢查比較簡單、快捷，可以顯示肛周的軟組織、肛管、肛門旁的膿腫形成，明確膿腫的具體位置，明確肛瘺的內口、外口，以及與肛門周圍皮膚的關系。但通常不能明確瘺管的內口、外口位置，也不能明確瘺管是否閉合，所以還需要結合其他檢查明確診斷。

1、肛周皮膚：進行肛周超聲時，可以明確肛周是否有皮下瘺道以及瘺管結構，而且可以了解瘺管的深淺位置;

2、肛管：通過超聲可以對肛管進行相應的測量，明確是否有內口、外口，以及瘺管的具體長度;

3、肛門旁：超聲可以對肛門旁的膿腫進行定位，明確是否有膿腫的穿行，而且可以測量膿腫的大小;

4、皮膚：除上述位置以外，超聲還可以對肛門周圍的皮膚進行相應的測量，明確是否有深部膿腫以及膿腫范圍。

除上述方法外，超聲也可以對肛門周圍進行照相、切片，觀察肛周皮膚是否出現紅腫、硬結等表現。如果發現有膿腫形成或者有瘺管，還可以通過超聲引導下的穿刺進行引流，定期換藥，可較好地改善患者的癥狀。

由于超聲檢查沒有X線輻射，因此可以作為初步診斷的方法。對于復雜性肛瘺患者，由于超聲可以對瘺管走行進行明確判斷，因此可以明確瘺管的具體位置，以及內口、外口位置，而且還能了解瘺管是否閉合，為手術提供依據。